Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPROQ16827 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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