Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NTRK2Q16620 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 486.5 ms