Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP7Q16576 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms