Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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