Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL1Q16048 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms