Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SIX1Q15475 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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