Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1121 ms