Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms