Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMC1AQ14683 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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