Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IHHQ14623 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IHHQ14623 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IHHQ14623 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IHHQ14623 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IHHQ14623 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms