Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms