Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCARF1Q14162 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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