Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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