Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNW1Q13573 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms