Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms