Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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