Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms