Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SRSF6Q13247 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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