Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RLFQ13129 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RLFQ13129 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RLFQ13129 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms