Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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TRAF1Q13077 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF1Q13077 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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