Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PTPN13Q12923 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PTPN13Q12923 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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