Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PTPRJQ12913 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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