Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TROQ12816 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TROQ12816 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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