Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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KCNMA1Q12791 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNMA1Q12791 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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