Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LOXL1Q08397 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL1Q08397 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms