Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSME1Q06323 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.7 ms