Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREMQ03060 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREMQ03060 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms