Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms