Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDR2Q01850 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms