Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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