Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms