Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBB4BP68371 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms