Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDST1P52848 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDST1P52848 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDST1P52848 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms