Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRB2P47870 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms