Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCAMP43121 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCAMP43121 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCAMP43121 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCAMP43121 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms