Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MLH1P40692 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms