Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBRP36941 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LTBRP36941 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBRP36941 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBRP36941 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms