Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5C1P36542 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms