Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms