Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GCAP28676 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GCAP28676 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GCAP28676 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms