Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms