Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTGS1P23219 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms