Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERCC2P18074 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms