Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XBP1P17861 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
XBP1P17861 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms