Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYN1P17600 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms