Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMPD1P17405 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms