Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODC1P11926 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms