Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM10L2BP0DMW5 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms