Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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