Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LMNAP02545 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms